ინფორმაცია

დნმ -ის შევსება საპირისპირო კომპლემენტარობის წინააღმდეგ

დნმ -ის შევსება საპირისპირო კომპლემენტარობის წინააღმდეგ


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

ვწუხვარ, რომ შევიწუხე ეს კითხვა (დაახლოებით რამდენიმე საათი ვსწავლობ გენეტიკას, რადგან მჭირდება ჩემი მონაცემების გაგება) და ძალიან დაბნეული ვარ ამ ორ ტერმინთან დაკავშირებით, რადგან არ ვიცი წიგნებში სიტყვა "უკუ" გამოიყენება თუ არა ურთიერთშენაცვლებით ან რა. აქ ხდება

მთავარი პრობლემა, რომელშიც მე მთლიანად დაბნეული ვარ, არის სიტყვები საპირისპირო კომპლემენტარულობა და დამატებითობა დნმ -ის ორი ჯაჭვიდან. რადგან ვიცი, რომ ჯაჭვები გადის ანტიპარალელური მიმართულებით და დნმ-ის ორი ჯაჭვი ერთმანეთს ავსებს: ანუ ACTCTG თანმიმდევრობა ავსებს TGAGAC-ს და პირიქით.

მაგრამ ჩემი შეკითხვა ასეთია: არის დნმ-ის ორი ჯაჭვი, რომლებიც ავსებენ ერთმანეთს? იმიტომ რომ სულ მცირე ორ წიგნში წავიკითხე, რომ დნმ-ის ორი ჯაჭვია. მაგრამ თუ გამოვიყენებდი ჩემს წინა მაგალითს და გამოვიყენებდი რევერსიას, მაშინ ვერანაირად ვერ მივაღწევ ჩემს სხვა სტრიქონს. ამ კონტექსტში სიტყვა საპირისპირო გამოიყენება როგორც ანტიპარალელურად (5' - 3' და 3' - 5') თუ რამე გამომრჩა და მართალია, თუ ავიღე დნმ-ის მთლიანი ჯაჭვი, შემიძლია გამოვიყენო და შევცვალო იგი და ეს მოხდება იყოს ჩემი მეორე შტრიხი?

კიდევ ერთხელ ვწუხვარ, რომ ვსვამ ამ მართლაც ძირითად კითხვას, მაგრამ მე ძალიან დაბნეული ვარ ამ პირობებში. კარგი დღე ყველას და მადლობა თუ ვინმეს ექნება დრო ჩემს კითხვაზე პასუხის გასაცემად.


ვეთანხმები, რომ განმარტებები შეიძლება გარკვეულწილად დამაბნეველი იყოს, როდესაც პირველად შეხვდებით. თითოეულ ნუკლეოტიდს აქვს კომპლემენტი A-T, C-G. მაგრამ დნმ-ის ჯაჭვი საპირისპირო-შემავსებელია, რადგან 5'->3'-დან გასწორებისას ისინი არ არიან (აუცილებლად) შემავსებელი.
Მაგალითად:
დნმ-ის ჯაჭვი 5'-ATCCGG-3'
კომპლემენტი 3'-TAGGCC-5'
უკანა 5'-CCGGAT-3 '

ვინაიდან ჩვენ გვინდა დავწეროთ ყველა მიმდევრობა ერთი მიმართულებით, ძაფს უნდა ვუწოდოთ უკუ-შემავსებელი


დნმ -ის კომპლემენტარობა საპირისპირო კომპლემენტარობის წინააღმდეგ - ბიოლოგია

უკუ და/ან შეავსებს დნმ -ის თანმიმდევრობას. გამოყავით თანმიმდევრობები ხაზების დაბრუნებით. კომპლემენტარულობა მოჰყვება IUPAC-ის კონვენციას.
IUPAC დეგენერაციები

ბაზასახელიწარმოდგენილი ბაზებიდამატებითი ბაზა
ადენინი
თიმიდინი
ურიდინი (მხოლოდ რნმ)
გუანიდინიC
CციტიდინიC
პირიმიდინიC T
ღორია გ
ძლიერი (3 ჰბონდი)გ გს*
სუსტი (2 ჰბონდი)W*
ქეთოტ/უ გ
მინოC
არა აC G T
არა CA G T
არა გA C T
არა T/UA C G
უცნობიA C G T
წყარო: http://hornet.bio.uci.edu/

hjm/projects/tacg/(აღარ არის ონლაინ)

* მადლობა Joost Kolkman– ს Maxygen– ში, რომელმაც აღნიშნა, რომ revcomp (S) = S და revcomp (W) = W ზემოთ წყაროში (აღარ არის ონლაინ), revcomp (S) იყო W და პირიქით, რაც არასწორია. ვიცოდი, მაგრამ არ გადამოწმებია.


BLAST და Reverse Complementary RNA– ს გაგება და miRcore– ის მომავალი ლიდერობის განხილვა

24 მარტის შეხვედრის დროს წევრებს გაეცნენ BLAST, ძირითადი ლოკალური განლაგების საძიებო ინსტრუმენტი (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). აქცენტი გაკეთდა ნუკლეოტიდის BLAST-ის გამოყენებაზე რნმ-ის თანმიმდევრობების შესატყვისად ფაილის ტიპიდან, სახელწოდებით FASTA რნმ-ის თანმიმდევრობაზე NCBI მონაცემთა ბაზაში. FASTA ფაილები შეიცავს სახელს თითოეული თანმიმდევრობისთვის და ნუკლეოტიდების თანმიმდევრობას თანმიმდევრობაში. FASTA ფაილიდან ხაზები შეიძლება გადაიწეროს BLAST-ში, რომელიც უზრუნველყოფს შესატყვისი თანმიმდევრობის ვიზუალურ შეჯამებას. იგი ასევე ჩამოთვლის ინფორმაციას თითოეული ცალკეული თანმიმდევრობის მატჩისთვის. შეხვედრის დროს განხილულ იქნა დნმ -ის საპირისპირო დამატებითი თანმიმდევრობის კონცეფცია, რათა განვმარტოთ, თუ რატომ დაარქმევს BLAST ზოგიერთ თანმიმდევრულ მატჩს "პლუს/პლუს" და სხვებს "პლუს/მინუს". დნმ-ს აქვს ორი ჯაჭვი (ეს არის ორმაგი სპირალი), რომლებიც საპირისპირო მიმართულებით მიდიან. ერთი მიმართულება არის "დადებითი" და ერთი "უარყოფითი". დნმ -ს აქვს 5 'ბოლო და 3' დასასრული. როდესაც რნმ გადაწერილია პოზიტიური ბილიკიდან, ის გადაიწერება დნმ -ის 3 ’ბოლოდან 5’ ბოლომდე. რნმ -ის 5 'ბოლო შეესაბამება დნმ -ის 3' ბოლოს და პირიქით. რნმ მიდის საპირისპირო მიმართულება დნმ -თან შედარებით, მაგრამ მისი ფუძე წყვილი მაინც ემთხვევა (მაგ. G- დან C- მდე). საპირისპირო შემავსებელი რნმ დადებითი ჯაჭვის დნმ -ის მიმდევრობისთვის იქნება იდენტური შესაბამისი უარყოფითი ძაფის დნმ -ის თანმიმდევრობისა. ქვემოთ მოყვანილი მაგალითისთვის, დადებითი ჯაჭვის საპირისპირო დამატებითი რნმ, წაკითხული 5' ბოლოდან, იქნება CAUCCU. რა რა იგივეა რაც უარყოფითი სტრიქონი, მხოლოდ T– ით შეიცვალა U– ით.

BLAST პოულობს ყველა შესატყვისს, რაც იცის, როგორც დადებითი, ასევე უარყოფითი ჯაჭვის დნმ -დან და რნმ -დან ეს განმარტავს, თუ რატომ არის ზოგიერთი შესატყვისი პლუს/პლუსი და ზოგი პლუს/მინუსი. ამასთან, სირთულის კიდევ ერთი ელემენტია ის, რომ რნმ მუშავდება ნაწილების, ანუ ინტრონების ამოღებით. ასე რომ, ყველა რნმ, რომელიც თავდაპირველად დნმ -დან არის გადაწერილი, არ ხდის მას რნმ -ის საბოლოო პროდუქტად. იმისდა მიხედვით, თუ რომელი ინტრონი ამოღებულია რნმ -დან, შეიძლება შეიქმნას სხვადასხვა „იზოფორმები“ (ვერსიები). იზოფორმების შექმნის პროცესს რნმ -ის სხვაგვარად დამუშავებით ეწოდება "ალტერნატიული შეხამება". BLAST პოულობს ბევრ განსხვავებულს RNA თანმიმდევრობის შეყვანისთვის, რომელიც შეიძლება იყოს ოდნავ განსხვავებული ან ჰქონდეს ხარვეზები ალტერნატიული შეხორცების გამო.

გამოსახულება: მე-2 ნომერში, „რნმ-ის დამუშავება“, ლურჯი მარყუჟები, რომლებიც ამოღებულია წითელი წინამრნმ-დან, არის ინტრონები.
სურათი miRcore საზაფხულო ბანაკის სლაიდშოუებიდან.

შეხვედრა დასრულდა წევრების წინადადებებით, თუ როგორ შეიძლება განსაზღვროს miRcore ლიდერობა მომავალში და რა თვისებები უნდა ჰქონდეს კარგ miRcore ლიდერს. წევრებმა შესთავაზეს განაცხადის შერწყმა და საარჩევნო პროცესები, რათა აირჩიონ ლიდერები და ისეთი კვალიფიკაციები, როგორიცაა გამოცდილება, დასწრება და, რა თქმა უნდა, თანაგრძნობა. ზოგიერთმა თქვა, რომ შეხვედრაზე წარმოქმნილი კარგი ლიდერული თვისებების ჩამონათვალში შედიოდა ერთმანეთთან შეუსაბამო თვისებები (მტკიცებულება და ღია გონება), მაგრამ შეთანხმდნენ, რომ ხასიათი იყო კარგი ლიდერობის მნიშვნელოვანი განმსაზღვრელი ფაქტორი. დისკუსია ჯერ კიდევ ღიაა, რადგან miRcorers განსაზღვრავენ მათი ორგანიზაციის მიმართულებას მომდევნო წლებში.


დნმ -ის კომპლემენტარობა საპირისპირო კომპლემენტარობის წინააღმდეგ - ბიოლოგია

ამ შინაარსის სანახავად საჭიროა J o VE-ის გამოწერა. თქვენ მხოლოდ პირველი 20 წამის ნახვას შეძლებთ.

JoVE ვიდეო პლეერი თავსებადია HTML5-თან და Adobe Flash-თან. ძველი ბრაუზერები, რომლებსაც არ აქვთ HTML5 და H.264 ვიდეო კოდეკის მხარდაჭერა, კვლავ გამოიყენებენ Flash დაფუძნებულ ვიდეო პლეერს. ჩვენ გირჩევთ ჩამოტვირთოთ Flash-ის უახლესი ვერსია აქ, მაგრამ ჩვენ მხარს ვუჭერთ ყველა ვერსიას 10 და ზემოთ.

თუ ეს არ დაგვეხმარა, გთხოვთ შეგვატყობინოთ.

სხეულის თითქმის ყველა უჯრედს აქვს ერთი და იგივე დნმ, მაგრამ უჯრედების განსხვავებული ტიპები, როგორიცაა ნეირონები და კუნთების უჯრედები, გამოხატავს სხვადასხვა გენს, რადგან თითოეულ უჯრედში მხოლოდ გარკვეული გენია ტრანსკრიფცირებული მაცნე რნმ -ში, ანუ mRNA- ში. ლაბორატორიაში mRNAs შეიძლება გამოყენებულ იქნას როგორც შაბლონი დამატებითი დნმ-ის, cDNA-ს სინთეზისთვის, გენის ექსპრესიის შესასწავლად. გავრცელებული მეთოდია უჯრედებიდან რნმ-ის ამოღება, შემდეგ კი რნმ-ის იზოლირება რნმ-ის სხვა ტიპებიდან, როგორიცაა რიბოსომური რნმ ან რნმ-ის გადაცემა, ნიმუშის მძივების სვეტზე მიმაგრებული თიმინის ნუკლეოტიდების მონაკვეთებით.

ისინი აკავშირებენ პოლი-A კუდს, ადენინის ნუკლეოტიდების ჯაჭვს, რომელიც სპეციალურად არის წარმოდგენილი ევკარიოტული mRNA– ის 3 მთავარ ბოლოზე. რნმ -ის სხვა ტიპები არ იკვრება და ირეცხება.

mRNA-ის იზოლირების შემდეგ, პოლი-T პრაიმერი უკავშირდება პოლი-A კუდს, რაც უზრუნველყოფს საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას ფერმენტების საწყის წერტილს mRNA-დან ერთჯაჭვიანი cDNA-ს ტრანსკრიბციისთვის. ქიმიკატები, როგორიცაა RNase ფერმენტები, შემდეგ ემატება რნმ -ის დეგრადაციას.

დნმ პოლიმერაზას ფერმენტები გამოიყენება cDNA– ს დამატებითი ძაფის სინთეზისთვის, რის შედეგადაც წარმოიქმნება ორჯაჭვიანი cDNA, რომელიც შეიძლება შეიყვანოს ბაქტერიულ ან ვირუსულ ვექტორში და გამოყენებულ იქნას მოლეკულური ბიოლოგიის კვლევაში.

15.13: დამატებითი დნმ

მიმოხილვა

აქტიური ან გამოხატული მხოლოდ გენებია, რომლებიც ტრანსკრიბირებულია მესენჯერ რნმ-ში (mRNA). ამრიგად, მეცნიერებს შეუძლიათ ამოიღონ mRNA უჯრედებიდან, რათა შეისწავლონ გენის ექსპრესია სხვადასხვა უჯრედებსა და ქსოვილებში. მეცნიერი გარდაქმნის mRNA-ს დამატებით დნმ-ად (cDNA) საპირისპირო ტრანსკრიფციის გზით. იმის გამო, რომ mRNA არ შეიცავს ინტრონებს (არაკოდირებულ რეგიონებს) და სხვა მარეგულირებელ თანმიმდევრობებს, cDNA&mdashunlike გენომიური დნმ&mdash ასევე საშუალებას აძლევს მკვლევარებს პირდაპირ განსაზღვრონ გენის მიერ კოდირებული პეპტიდის ამინომჟავების თანმიმდევრობა.

CDNA სინთეზი

cDNA შეიძლება წარმოიქმნას რამდენიმე მეთოდით, მაგრამ საერთო გზა არის უჯრედებიდან მთლიანი რნმ -ის ამოღება, შემდეგ კი mRNA- ს იზოლირება უფრო დომინანტური ტიპებისაგან და გადაცემის გადაცემის რნმ (tRNA) და რიბოსომული (rRNA). მოწიფულ ევკარიოტულ mRNA– ს აქვს ადენინის ნუკლეოტიდების პოლი (A) კუდი და მდაშა სტრიქონი და მოთავსებულია მის 3 ბოლომდე, ხოლო რნმ – ს სხვა ტიპებს არა. მაშასადამე, თიმინის ნუკლეოტიდების (oligo-dTs) სტრიქონი შეიძლება მიმაგრდეს ისეთ სუბსტრატზე, როგორიცაა სვეტი ან მაგნიტური მძივები, რათა კონკრეტულად მოხდეს ფუძე-წყვილი mRNA-ს პოლი(A) კუდებთან. სანამ mRNA პოლი(A) კუდით არის დაჭერილი, რნმ-ის სხვა ტიპები ირეცხება.

შემდეგი, საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა და mdasha დნმ პოლიმერაზა ფერმენტი რეტროვირუსებიდან და mdashis გამოიყენება mRNA-დან cDNA-ს გენერირებისთვის. ვინაიდან, ისევე როგორც დნმ პოლიმერაზების უმეტესობას, საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას შეუძლია ნუკლეოტიდების დამატება ჯაჭვის მხოლოდ 3&rsquo ბოლოში, ემატება პოლი(T) პრაიმერი პოლი(A) კუდთან დასაკავშირებლად, რათა უზრუნველყოს საწყისი წერტილი cDNA სინთეზისთვის. cDNA ჯაჭვი მთავრდება თმის სამაგრით. რნმ-ის შემდეგ დეგრადირდება და ხშირად ხდება ტუტეებით დამუშავება ან რნაზის ფერმენტები და ერთჯერადი ჯაჭვის cDNA ხელუხლებელი დატოვება.

მეორე დნმ-ის ჯაჭვი, რომელიც ავსებს cDNA-ს, შემდეგ სინთეზირდება დნმ პოლიმერაზას მიერ და ხშირად გამოიყენება პირველი cDNA ჯაჭვის თმის სამაგრის მარყუჟის ან mRNA-ის ჩირქოვანი ნაწილის გამოყენებით, როგორც პრაიმერი.

შედეგად მიღებული ორჯაჭვიანი cDNA შეიძლება ჩაისვას ბაქტერიულ ან ვირუსულ ვექტორებში და მოხდეს მისი კლონირება მოლეკულური ბიოლოგიის სტანდარტული ტექნიკის გამოყენებით. CDNA ბიბლიოთეკა და mdash, რომელიც წარმოადგენს ყველა mRNA- ს უჯრედებში ან ქსოვილებში და mdashcan ასევე აშენდება დამატებითი კვლევისთვის.

ილოცეთ, ლესლი ა. &ldquoბიოტექნოლოგიური რევოლუცია: PCR და საპირისპირო ტრანსკრიპტაზის გამოყენება გამოხატული გენების კლონირებისთვის.&rdquo ბუნების განათლება 1, არა. 1 (2008): 94. [წყარო]


საბოლოო აზრები

გმადლობთ, რომ წაიკითხეთ ახალი წინასწარი დაბეჭდვის "გაუმჯობესებული არქიტექტურა დნმ-ის მოქნილი წარმოებისთვის სიცოცხლის სამეფოებში რეტრონების გამოყენებით" შიპმენის ლაბორატორიიდან სან-ფრანცისკოს გლადსტოუნის ინსტიტუტებში. თუ მოლეკულური ინსტრუმენტების შემქმნელი გახდომა უფრო საინტერესო ჟღერს, ვიდრე სარეკლამო შემოსავლის ოპტიმიზაცია, უნდა განიხილონ განაცხადი Shipman Lab– თან მუშაობისთვის! ახალგაზრდა ჯგუფი ეძებს ახალ წევრებს და ეს არის შანსი შეხვიდეთ პირველ სართულზე ლაბორატორიით, რომელიც ასრულებს სინთეზურ ბიოლოგიაში ყველაზე საინტერესო და ინოვაციურ სამუშაოს.

თუ თქვენ სიამოვნებით წაიკითხეთ ეს და დაგაინტერესებთ ახლის ხაზგასმა ღია წვდომა ქაღალდი თქვენს შემოსულებში ყოველ კვირას, თქვენ უნდა გაითვალისწინოთ გამოწერა:

თუ ფიქრობთ, რომ ვიღაცას, ვისაც იცნობთ, ასევე მოეწონება ეს პოსტი, გაუზიარეთ მათ:

ეს ბიულეტენი შეიძლება გაიზარდოს მხოლოდ თქვენი მხარდაჭერით. სულ ეს არის ამ კვირისთვის, გისურვებთ მშვენიერ კვირას!

ეს აშკარად გამარტივებული კლასიფიკაციაა, მაგრამ შეიძლება საინტერესო შეკითხვა იყოს. ცილაზე ორიენტირებული ერთ – ერთი მართლაც საინტერესო პროგრამაა მუჰამედ ალკურაიშის, რომელმაც კოლუმბიაში ახალი ლაბორატორია შექმნა 2050 წლისთვის სტრუქტურული გარჩევადობის მქონე უჯრედის სიმულაციის თამამი ხედვით. ასეთი სისტემური დონის „სტრუქტურული უჯრედების ბიოლოგია“ წარმოუდგენელი იქნება. რა

ნაშრომი არის "Refactoring bacteriophage T7" ენდის ლაბორატორიიდან. ეს არის თვითნებური მაგალითი და მე არ ვაპირებ დეტალურად განვიხილოთ სინთეზური ბიოლოგიის ისტორია, დნმ-ზე დაფუძნებული პროგრამირების ენები, ან დნმ გამოთვლის მთელი სფერო.


შაბლონის გადართვა II ჯგუფის ინტრონული საპირისპირო ტრანსკრიპტაზით: ბიოქიმიური ანალიზი და შედეგები რნმ-სეკზე

საპირისპირო ტრანსკრიპტაზები (RT), რომლებიც დაშიფრულია მობილური ჯგუფის II ინტრონით და სხვა არა LTR- რეტრო ელემენტებით, განსხვავდება რეტროვირუსული RT– ებისგან იმით, რომ მათ შეუძლიათ შაბლონის გადართვა ერთი შაბლონის 5 'ბოლოდან მეორეზე 3' ბოლომდე წინასწარი არსებობის გარეშე კომპლემენტარობა დონორსა და მიმღებს ნუკლეინის მჟავებს შორის. აქ, ჩვენ გამოვიყენეთ II ჯგუფის თერმდგრადი ინტრონის RT (TGIRT GsI-IIC RT) უნარი, რომ თარგის გადართვა პირდაპირ სინთეზური რნმ შაბლონიდან/დნმ პრაიმერის დუპლექსებიდან, რომლებსაც აქვთ ბლაგვი ბოლო ან 3'-დნმ გადახურვის ბოლო, სრული კინეტიკის დასამყარებლად. ჩარჩო რეაქციისთვის და იმ პირობების იდენტიფიცირება, რომლებიც უფრო ეფექტურად იპყრობს მიმღებ რნმ -ებს ან დნმ -ებს. შაბლონის გადართვის სიჩქარე და ამპლიტუდა ოპტიმალურია საწყისი დუპლექსიდან ერთი ნუკლეოტიდით 3'-დნმ-ით გადახურული მიმღები რნმ-ის 3 'ნუკლეოტიდით, რაც მიგვითითებს როლზე დამატებითი ნუკლეოტიდის არა-შაბლონური ნუკლეოტიდის დამატებაზე 3' ბოლომდე cDNA– ები სინთეზირებულია ბუნებრივი შაბლონებიდან. უფრო გრძელი 3'-დნმ გადახრა თანდათან ამცირებს შაბლონის გადართვის მაჩვენებელს, მაშინაც კი, როდესაც მიმღები შაბლონის მე -3 ბოლომდე ავსებს. მიმღების 3 ’ნუკლეოტიდთან ერთად ერთ ფუძე წყვილზე დამოკიდებულება შეუსაბამობების დისკრიმინაციასთან და ფერმენტის მაღალ პროცესუალურობასთან ერთად იძლევა ნუკლეინის მჟავების დნმ-ის სრულმეტრაჟიანი სინთეზის სინთეზს, რომელიც იწყება უშუალოდ მათი მე –3 ბოლოდან. ჩვენ განვიხილავთ II ჯგუფის ინტრონის შაბლონური გადართვის აქტივობის და სხვა არა LTR- რეტროელემენტების RT– ების შესაძლო ბიოლოგიურ ფუნქციებს, ასევე ამ აქტივობის ოპტიმიზაციას ადაპტერის დამატებისთვის რნმ – ში და დნმ – ში.


Შემაჯამებელი

  1. შედარებით ცოტა ანტივირუსული ქიმიოთერაპიული საშუალება არსებობს ამჟამად და ისინი მხოლოდ გარკვეულწილად ეფექტურია მხოლოდ რამდენიმე შეზღუდული ვირუსის წინააღმდეგ.
  2. ბევრი ანტივირუსული აგენტი ჰგავს ნორმალურ დნმ-ის ნუკლეოზიდების მოლეკულებს და მუშაობს ვირუსული დნმ-ის სინთეზის ინჰიბირებით.
  3. ზოგიერთი ანტივირუსული აგენტი არის პროტეაზას ინჰიბიტორი, რომელიც უკავშირდება ვირუსულ პროტეაზას და ხელს უშლის მას პოლიცისტრონული გენებიდან გრძელი პოლიპროტეინის დაშლაში ვირუსული სტრუქტურისა და ფუნქციისათვის აუცილებელ პროტეინებად.
  4. ზოგიერთი ანტივირუსული აგენტი არის შესვლის ინჰიბიტორი, რომელიც ხელს უშლის ვირუსის მასპინძელ უჯრედთან შეკავშირებას ან შეღწევას.
  5. ანტივირუსული საშუალებები ხელმისაწვდომია მხოლოდ რამდენიმე ვირუსზე, მათ შორის გრიპის ვირუსების, ჰერპესის ვირუსების, ციტომეგალოვირუსების, C ჰეპატიტის ვირუსებისა და აივ ინფექციის ჩათვლით.
  6. გარკვეული ინტერფერონის ციტოკინები წარმოებულია დნმ -ის რეკომბინანტული ტექნოლოგიით და რამდენიმე გამოიყენება გარკვეული მძიმე ვირუსული ინფექციების დროს.

250+ TOP MCQ უკუ ტრანსკრიპტაზას PCR-ზე და პასუხებზე

მოლეკულური ბიოლოგიის მრავალჯერადი არჩევანის კითხვები "რევერსი ტრანსკრიპტაზას PCR"-ზე.

1. საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა წარმოქმნის დნმ -ს რნმ -დან.
ა მართალია
ბ მცდარი

პასუხი: ბ
ახსნა: დნმ -ის წარმოება რნმ -დან არის ტრანსკრიფციის საპირისპირო პროცესი. ასეთი დნმ -ის წარმოება არ იქნება ზუსტად მისი მშობლის გენი, რადგან მას არ ექნება ინტრონები რნმ -დან გარდაქმნისას. ამ რეაქციას ხელს უწყობს ფერმენტი საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა და ამგვარად წარმოქმნილი დნმ ცნობილია როგორც დამატებითი დნმ ან cDNA.

2. ჩამოთვლილთაგან რომელია პირველი პრაიმერი RT - PCR-ში ევკარიოტული რნმ-ისთვის?
ა.ოლიგო ა
ბ.ოლიგო ტ
C. ოლიგო გ
დ. ოლიგო გ

პასუხი: ბ
ახსნა: ყველა რნმ-ს აქვს პოლი – კუდი დამატებული მის 3’ ბოლოზე, როგორც პოსტტრანსკრიპციული მოდიფიკაცია. ამრიგად, საპირისპირო ტრანსკრიფციის დროს ეს პოლი – კუდი გამოიყენება როგორც შაბლონის ჯაჭვი და ოლიგო T-ის პრაიმერი, რომელიც გამოიყენება cDNA ჯაჭვის სინთეზისთვის.

3. RT - PCR– ში ფერმენტი დეოქსინუკლეოტიდილ ტრანსფერაზა ამატებს პოლი - G ნარჩენებს __________
ა. 5 ’რნმ -ის დასასრული
B. 3 ’რნმ -ის დასასრული
C. 3 ’cDNA დასასრული
D. 5 ’cDNA დასასრული

პასუხი: გ
ახსნა: cDNA მოლეკულის დამატებითი ძაფის სინთეზის დროს, მისი 3 ’ბოლო უცნობია. ამრიგად, არ შეიძლება შეიქმნას პრაიმერი, რომელსაც შეუძლია მისი დამატებითი ძაფების სინთეზირება. აქ ფერმენტი დეოქსინუკლეოტიდილ ტრანსფერაზა ამატებს პოლი - G ნარჩენებს cDNA– ს 3 ’ბოლოში, ისე რომ ოლიგო C პრაიმერი შეიძლება გამოყენებულ იქნას მისი დამატებითი ძაფის სინთეზისათვის.

4. RT - PCR დროს mRNA- ის მონელება ხორციელდება ფერმენტი ____________
A. ეგზონუკლეაზა
ბ. რნასე ჰ
C. ბალ 31
დ ენდონუკლეაზა

პასუხი: ბ
განმარტება: ეგზონუკლეზა და ენდონუკლეზა ორივე ზღუდავს დნმ -ს ფრაგმენტებს და ბალ 31 არის ეგზონუკლეაზის ტიპი. RNase H იწვევს mRNA მონელებას RT - PCR-ის დროს.

5. რამდენი პრაიმერი გამოიყენება საპირისპირო ტრანსკრიპტაზას ამპლიფიკაციის პროცესში?
ა 1
B. 2
C. 3
D. 4

პასუხი: ბ
ახსნა: ოლიგო - T– ის პირველი პრაიმერი გამოიყენება mRNA– ს საპირისპირო ტრანსკრიფციისას cDNA– ზე. წარმოებული cDNA არის ერთჯაჭვიანი მოლეკულა, ამიტომ მისი დამატებითი ძაფის სინთეზი აუცილებელია. პოლი G/C კუდი ემატება მის 3' ბოლოს და ამგვარად მეორე პრაიმერი გამოიყენება ამ პოლი G/C კუდის წინააღმდეგ cDNA დუპლექსის სინთეზისთვის.

6. რომელი ორგანიზმიდან გამოიყოფა ფერმენტი უკუ ტრანსკრიპტაზა?
ა.ბაქტერიები
ბ სოკოები
C. ვირუსი
დ. პრიონები

პასუხი: გ
ახსნა: ზოგიერთ ვირუსს აქვს RNA როგორც გენეტიკური მასალა. ეს ვირუსები ატარებენ დამატებით პროტეინს cDNA-ს სინთეზისთვის, რათა ის ეფექტურად ჩაერთოს მასპინძელ ქრომოსომაში. ეს ფერმენტი, რომელსაც იყენებენ ვირუსები, არის საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა. ასეთი ვირუსების მაგალითებია რეტროვირუსი, ადამიანის პაპილომა ვირუსი და ა.შ.

7. cDNA ბიბლიოთეკა უზრუნველყოფს რამდენიმე უპირატესობას RT - PCR-სთან შედარებით.
ა მართალია
B. ყალბი

პასუხი: ბ
განმარტება: 5 ’სპეციფიკური პრაიმერის გამოყენება გამორიცხავს ნაწილობრივი cDNA– ების გაძლიერების რისკს. ამრიგად, პროცედურა იმდენად მგრძნობიარეა, რომ მთლიანი უჯრედული რნმ შეიძლება გამოყენებულ იქნას RT - PCR და mRNA გამოყოფის ნაბიჯი არასაჭიროა. ამრიგად, RT - PCR გვთავაზობს რამდენიმე უპირატესობას cDNA ბიბლიოთეკასთან შედარებით კონკრეტული გენის გამოყოფისთვის, თუ საკმარისი ინფორმაციაა ხელმისაწვდომი.

8. ________________ არის RT – PCR-ის მოდიფიკაცია.
A. გადახურვის გაფართოების PCR
B. ინვერსიული PCR
გ. თერმული ციკლის თანმიმდევრობა PCR
D. რასის


საპირისპირო ტრანსკრიფცია (cDNA სინთეზი)

რნმ-ის შაბლონიდან დნმ-ის სინთეზი, საპირისპირო ტრანსკრიფციის გზით, წარმოქმნის დამატებით დნმ-ს (cDNA). საპირისპირო ტრანსკრიპტაზები (RTs) იყენებენ რნმ -ს შაბლონს და მოკლე პრაიმერს, რომელიც ავსებს რნმ -ის 3 'ბოლომდე, რათა მიმართოს პირველი ჯაჭვის cDNA სინთეზი, რომელიც შეიძლება გამოყენებულ იქნას უშუალოდ პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის (PCR) შაბლონად. საპირისპირო ტრანსკრიფციისა და PCR (RT-PCR) ეს კომბინაცია საშუალებას იძლევა გამოავლინოს მცირე რაოდენობით რნმ-ები ნიმუშში და შექმნას შესაბამისი cDNA, რითაც ხელს უწყობს დაბალი ასლის გენების კლონირებას. ალტერნატიულად, პირველი ჯაჭვის cDNA შეიძლება გახდეს ორჯაჭვიანი დნმ პოლიმერაზა I და დნმ ლიგაზას გამოყენებით. ამ რეაქციის პროდუქტების გამოყენება შესაძლებელია პირდაპირი კლონირებისთვის გაძლიერების გარეშე. ამ შემთხვევაში, RNase H აქტივობა, RT– დან ან მიეწოდება ეგზოგენურად, საჭიროა.

ბევრი RT ხელმისაწვდომია კომერციული მომწოდებლებისგან. ფრინველის მიელობლასტოზის ვირუსი (AMV) საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა და მოლონი თაგვის ლეიკემიის ვირუსი (M-MuLV, MMLV) საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა არის RT, რომლებიც ჩვეულებრივ გამოიყენება მოლეკულური ბიოლოგიის სამუშაო პროცესებში. M-MuLV უკუ ტრანსკრიპტაზას აკლია 3 და მწვავე და rarr 5 და მწვავე ეგზონუკლეაზის აქტივობა. ProtoScript ® II საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა არის რეკომბინანტული M-MuLV საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა შემცირებული RNase H აქტივობით და გაზრდილი თერმოსტაბილურობით. მისი გამოყენება შესაძლებელია პირველი ჯაჭვის cDNA-ს სინთეზისთვის უფრო მაღალ ტემპერატურაზე, ვიდრე ველური ტიპის M-MuLV. ფერმენტი აქტიურია 50 ° C– მდე, რაც უზრუნველყოფს უფრო მაღალ სპეციფიკას, cDNA– ს უფრო მაღალ მოსავალს და უფრო სრულმეტრაჟიანი cDNA პროდუქტს, 12 კბ – მდე სიგრძემდე.

ინჟინერირებული RT– ების გამოყენება აუმჯობესებს პროდუქტის სრულმეტრაჟიანი წარმოქმნის ეფექტურობას, რაც უზრუნველყოფს mRNA ტრანსკრიპტის 5 ’ბოლოის კოპირების დასრულებას და რნმ თანმიმდევრობის ერთგული დნმ ასლის გამრავლებას და დახასიათებას. უფრო თერმოსტაბილი RT– ების გამოყენება, სადაც რეაქციები ტარდება უფრო მაღალ ტემპერატურაზე, შეიძლება ძალიან გამოსადეგი იყოს რნმ – თან ურთიერთობისას, რომელიც შეიცავს დიდი რაოდენობით მეორადი სტრუქტურას.

ხელმისაწვდომი RT და cDNA სინთეზის რეაგენტების შედარებისთვის იხილეთ ჩვენი RT/cDNA სინთეზის შერჩევის სქემა.

აირჩიეთ ტიპი:

ეს პროდუქტი დაფარულია ერთი ან მეტი პატენტით, სავაჭრო ნიშნით და/ან საავტორო უფლებით, რომელსაც ფლობს ან აკონტროლებს New England Biolabs, Inc (NEB).

მიუხედავად იმისა, რომ NEB ავითარებს და ადასტურებს თავის პროდუქტებს სხვადასხვა პროგრამებისთვის, ამ პროდუქტის გამოყენებამ შეიძლება მოითხოვოს მყიდველი მიიღოს მესამე მხარის დამატებითი ინტელექტუალური საკუთრების უფლებები გარკვეული პროგრამებისთვის.

კომერციული უფლებების შესახებ დამატებითი ინფორმაციისათვის მიმართეთ NEB– ს გლობალური ბიზნესის განვითარების გუნდს [email protected]

ეს პროდუქტი განკუთვნილია მხოლოდ კვლევის მიზნებისთვის. ეს პროდუქტი არ არის განკუთვნილი ადამიანებსა და ცხოველებში სამკურნალო ან დიაგნოსტიკური მიზნებისათვის.


ნაწილი 2: გაფართოებული გამოცემა: საპირისპირო ტრანსკრიპტაზის აღმოჩენა

00: 00: 1420 გამარჯობა.
00:00:1520 მე ვარ დევიდ ბალტიმორი.
00: 00: 1620 მე ვარ კალიფორნიის ტექნოლოგიური ინსტიტუტის პროფესორი - Caltech.
00: 00: 2302 და მე აქ ვარ ვირუსებზე სასაუბროდ.
00: 00: 2516 მე ვმუშაობ ვირუსებზე, 50 წელზე მეტია.
00: 00: 3014 და მე ისინი მომხიბლავი მგონია.
00:00:3420 და მე კონცენტრირებას გავაკეთებ აივ-ზე, რადგან ეს არის ვირუსი, რომელიც ბევრმა იცის.
00: 00: 4114 და რა თქმა უნდა, ეს არის მე –20 და 21 – ე საუკუნის უბედურება.
00: 00: 4706 ასე რომ, მე ვირუსებს ვუწოდებ ცოცხალი სამყაროს ცალკეულ სამეფოს.
00: 00: 5112 ისინი ნამდვილად არ არიან სამეფო, მაგრამ ისინი იმდენად განსხვავდებიან სხვა ორგანიზმებისგან, რომლებიც
00: 00: 5713 ისინი ძალიან ცალკე უნდა ჩაითვალოს.
00: 00: 5927 ისინი ძალიან პატარები არიან.
00: 01: 0200 მათ შეუძლიათ საკუთარი თავის დუბლიკატი მხოლოდ ცოცხალ უჯრედებში შეღწევით და უჯრედების გადატანით
00: 01: 0924 უჯრედების მოქმედება ბოლომდე, რომლებიც ნაკარნახევია ვირუსის გენეტიკით.
00:01:1617 და, ამრიგად, ისინი სავალდებულო უჯრედული პარაზიტები არიან.
00: 01: 2017 ვირუსები შეიძლება არსებობდეს მხოლოდ ერთ უჯრედში. შეიძლება არსებობდეს მხოლოდ უჯრედების განვითარების შემდეგ.
00: 01: 2818 მათ შეიძლება ჰქონდეთ ან რნმ ან დნმ, როგორც მათი გენეტიკური მასალა დანარჩენ ბიოლოგიურ სამყაროში
00: 01: 3409 იყენებს დნმ -ს.
00:01:3803 და მათ შეუძლიათ გაიზარდონ ყველა სახის უჯრედში: ცხოველურ უჯრედებში, ბაქტერიებში, მცენარეებში.
00:01:4527 და ის ფაქტი, რომ ამდენი მათგანი რნმ ვირუსია, მიუთითებს იმაზე, რომ ისინი დარჩა
00: 01: 5220 რნმ სამყარო, რომელიც იყო შუამავალი იმ ევოლუციის სამყაროში, რომელსაც ჩვენ ვიცნობთ დღეს,
00: 02: 0016 რომელიც ემყარება როგორც დნმ -ს, ასევე რნმ -ს.
00: 02: 0418 მოლეკულური ბიოლოგიის ცენტრალური დოგმა არ შეცვლილა 1950 -იანი წლებიდან, როდესაც ის იყო
00: 02: 1208 პირველად გამოთქვა ფრენსის კრიკმა.
00: 02: 1803 და ეს არის ის, რომ დნმ -ს შეუძლია საკუთარი თავის დუბლირება, მისი ტრანსკრიფცია რნმ -ში და ეს რნმ
00:02:2421 თავის მხრივ შეიძლება იყოს შაბლონი ცილის დასამზადებლად.
00:02:2812 და ცილა არის ის, რაც სიცოცხლეს ამუშავებს.
00:02:3204 ჩვენი ყველა უჯრედი აგებულია ცილებისგან.
00:02:3415 ჩვენი ცხოვრების ყველა მოვლენა განისაზღვრება ცილებით.
00: 02: 4113 1970 წელს, მე ვირუსზე ვმუშაობდი და მე მქონდა ბედნიერება აღმოვაჩინო, რომ
00: 02: 4724 ოდნავ შეცვალა ცენტრალური დოგმა.
00:02:5126 ჩვენ აღმოვაჩინეთ საპირისპირო ტრანსკრიფცია: რნმ წარმოშობს დნმ-ს.
00:02:5918 და ეს საპირისპირო ტრანსკრიფცია რეალურად წარმოშობს დნმ-ის ძალიან დიდ რაოდენობას
00: 03: 0904 ჩვენგანი და ყველაზე მაღალი ორგანიზმები.
00: 03: 1215 საპირისპირო ტრანსკრიფციის აღმოჩენამ შეავსო ჩვენი გაგება ლოგიკის შესახებ
00: 03: 1827 როგორ მრავლდება ვირუსები.
00: 03: 2210 და ნება მომეცით აღვწერო ეს ლოგიკა ყველაზე მნიშვნელოვან პროდუქტზე ფოკუსირებით
00: 03: 2905 დამზადებულია ვირუსული ინფექციის დროს, რომელიც არის მაცნე რნმ.
00: 03: 3405 მესენჯერის რნმ აკოდირებს ცილებს.
00:03:3714 და ამ პროტეინებს, ახლა უკვე ვირუსულ ცილებს, შეუძლიათ უჯრედის ხელში ჩაგდება და მეტი ვირუსის ნაწილაკების შექმნა.
00: 03: 4701 ისინი ვირუსის ინფექციის პროცესის არსია.
00: 03: 5205 და ასე, ნუკლეინის მჟავა, ვირუსის დნმ ან რნმ, შეიცავს მითითებებს
00: 04: 0006 იმ ცილების დასამზადებლად.
00: 04: 0212 და ისმის კითხვა, როგორ მიდის ეს ინსტრუქციები ცილის წარმოებაში?
00: 04: 0804 და მართლაც ექვსი გზა არსებობს, რაც შეიძლება მოხდეს, ეს ზუსტად დამოკიდებულია ინსტრუქციებზე
00: 04: 1511 გადადის.
00:04:1800 და ეს ექვსი გზა განასხვავებს ვირუსების ერთ კლასს ვირუსების სხვა კლასისგან.
00:04:2502 ასე რომ, ყველაზე მარტივი, პირდაპირი არის ორჯაჭვიანი დნმ ვირუსები,
00: 04: 3112 I კლასის ვირუსები.
00:04:3419 ისინი უბრალოდ ქმნიან მესინჯერ რნმ-ს, ისევე როგორც ჩვენ ვაკეთებთ მესინჯერ რნმ-ს ჩვენს ნორმალურ უჯრედებში,
00: 04: 4203 იმიტომ, რომ ჩვენ ვატარებთ ორჯაჭვიან დნმ-ს, როგორც ჩვენს მემკვიდრეობით მასალას.
00:04:4721 შემდეგ არის ერთჯაჭვიანი დნმ ვირუსები.
00: 04: 5011 ისინი უნდა გახდნენ ორმაგი ბოჭკო - ეს არის II კლასის ვირუსი - და შემდეგ
00: 04: 5524 მათ შეუძლიათ შექმნან მაცნე რნმ.
00:04:5812 და შემდეგ მათ კვლავ უნდა გააკეთონ ეს ცალკეული ძაფები, რომ იყოს გენეტიკური მასალა
00:05:0228 ეს ვირუსები.
00: 05: 0408 შემდეგ არის RNA ვირუსები.
00: 05: 0711 არსებობს ორჯაჭვიანი რნმ ვირუსები, რომლებიც ძალიან ჰგავს ორჯაჭვიანი დნმ ვირუსებს
00:05:1226 გარდა იმისა, რომ ისინი რნმ არიან.
00: 05: 1515 და ისინი ქმნიან მაცნე რნმ-ს თავიანთი ორჯაჭვიანი რნმ-დან.
00: 05: 2010 არსებობს ორი სახის ერთჯაჭვიანი რნმ-ვირუსი.
00:05:2402 მათ შეუძლიათ ატარონ გენეტიკური მასალის გრძნობათა ჯაჭვი, რომელსაც ჩვენ ვუწოდებთ პლუს ძაფს,
00: 05: 3314 ამ შემთხვევაში მათ შეუძლიათ ცილის კოდირება უჯრედში ჩადებით.
00:05:4021 ან მათ შეუძლიათ V კლასის ვირუსებში ატარონ მინუს ძაფები, დამატებითი ძაფები.
00:05:4706 ეს უაზროა, სანამ არ დაკოპირდება პლიუს ზოლში.
00:05:5204 და ამიტომ საჭიროა მისი კოპირება, სანამ მას შეუძლია ცილის შექმნა.
00:05:5720 და ვირუსის ნაწილაკს უნდა ჰქონდეს პოლიმერაზა ამისთვის.
00: 06: 0328 და შემდეგ ხდება საპირისპირო ტრანსკრიფციის პროცესი, რომლის დროსაც რნმ -ს ვირუსი ატარებს,
00: 06: 0821 მაგრამ ეს. ის გადაწერილია, ჯერ ერთჯაჭვიანი დნმ-ში, შემდეგ ორჯაჭვიანი დნმ-ში და შემდეგ
00:06:1419 არის შაბლონი მესინჯერის რნმ-ის შესაქმნელად.
00:06:1728 ასე რომ, ეს გვაძლევს ექვს სხვადასხვა სახის ვირუსს.
00:06:2122 ვურეკავ მათ. მას უწოდებენ ბალტიმორის კლასიფიკაციას, რადგან ჩვენ პირველად გამოვთქვით იგი 1970 წელს.
00:06:3213 და ბევრი სახელმძღვანელო იყენებს მას, როგორც ორგანიზების საშუალებას. ვირუსებზე ფიქრი.
00:06:3726 და. მაგრამ ეს ნამდვილად არ არის კლასიფიკაცია.
00: 06: 4206 ეს არის განცხადება იმის შესახებ, თუ როგორ შეესაბამება ვირუსები მათ სტილს გენეტიკური ინფორმაციის მართვისას
00:06:4922 ცენტრალური დოგმის საჭიროებებზე.
00:06:5204 ახლა, რამდენი ვირუსია?
00: 06: 5501 არსებობს ვირუსების უთვალავი რაოდენობა.
00: 06: 5810 ცხოველთა სამყაროში ყველა ცხოველს აქვს საკუთარი ვირუსები, ყველა ბაქტერიას აქვს
00: 07: 0326 ვირუსების საკუთარი ნაკრები.
00: 07: 0604 რა თქმა უნდა არსებობს მილიონი ვირუსი, რომლებიც ადვილად განასხვავებენ ერთმანეთისგან,
00:07:1213 და გაკეთდა მრავალი შეფასება, რომელიც ბევრად აღემატება მას.
00:07:1809 იმის გამო, რომ ვირუსები შეიძლება გაიზარდოს მხოლოდ უჯრედებში, ისინი უნდა მოხვდნენ უჯრედში.
00: 07: 2322 მაგრამ როდესაც ისინი იქ შევლენ, მათ შეუძლიათ ძალიან სწრაფად აიღონ საკანი.
00: 07: 2822 ზოგიერთ ვირუსს, განსაკუთრებით ბაქტერიას, აქვს სიცოცხლის ციკლი მხოლოდ 20 ან 30 წუთის განმავლობაში.
00: 07: 3701 და ძუძუმწოვართა ვირუსებსაც კი მხოლოდ რამდენიმე საათი სჭირდება საკუთარი თავის უზარმაზარი რაოდენობის ასლების შესაქმნელად.
00: 07: 4618 მათ შეუძლიათ გააგრძელონ ცხოვრება მხოლოდ იმ შემთხვევაში, თუ ისინი გადადიან ერთი ორგანიზმიდან მეორეზე, რადგან,
00: 07: 5210, როგორც სავალდებულო პარაზიტები, მათ არ შეუძლიათ დამოუკიდებლად იცხოვრონ მსოფლიოში.
00: 07: 5717 და ყველა ვირუსი არის გადაცემის ამბავი.
00: 08: 0205 ჩვენ ვიცით, რომ ადამიანებში გადაცემა შეიძლება შეიცავდეს ზედაპირზე ცემინებას ან შეხებას
00:08:0814 ავადმყოფი შეეხო.
00: 08: 1109 მაგრამ კატებისთვის გადაცემა სხვაა, მწერებისთვის კი გადაცემა სხვაგვარადაა,
00: 08: 1902 და ეს არის ვირუსების ევოლუციის ნაწილი.
00: 08: 2106 ისინი ვითარდებიან და ხდებიან თავიანთი მასპინძლების ცხოვრების სტილის ნაწილი.
00: 08: 2826 თუ ვირუსი ძალიან სპეციფიკურია სახეობისათვის, ისევე როგორც ადამიანის სახეობა, ჩვენ შეგვიძლია
00:08:3513 რეალურად მოიშორეთ ისინი, რადგან მათ არ აქვთ რეზერვუარი ჩვენს გარეთ.
00: 08: 4013 და თუ ჩვენ შეგვიძლია ვაქცინოთ მსოფლიოს მთელი მოსახლეობა, მაშინ ჩვენ შეგვიძლია მოვიშოროთ ეს ვირუსი,
00: 08: 4720 იმიტომ, რომ ჩვენ თავს დავიცავთ მისგან.
00: 08: 5121 და ჩვენ ეს გავაკეთეთ ჩუტყვავილასთან ერთად.
00: 08: 5317 ჩვენ თითქმის გავაკეთეთ ეს პოლიომიელიტით და მათ სჯერათ, რომ რამდენიმე წლის განმავლობაში
00: 09: 0023 პოლიო აღმოიფხვრება დედამიწიდან.
00: 09: 0514 ახლა, ვირუსები იზრდებიან უჯრედებში, რომ უჯრედებიდან ამოვიდნენ, მათ რაღაც უნდა გააკეთონ.
00: 09: 1413 და ისინი აკეთებენ ერთ ორ საქმეს, საერთოდ.
00:09:1712 ან დადებენ. ამოიღეთ უჯრედების ზედაპირიდან და ეს არის ის, რაც ამ სურათზე ჩანს,
00:09:2422 ან ისინი იზრდებიან დიდ რაოდენობამდე უჯრედის შიგნით და შემდეგ არღვევენ უჯრედს.
00: 09: 3215 და ეს ათავისუფლებს ვირუსის ნაწილაკებს უჯრედის შიგნიდან იქ, სადაც არ უნდა იყოს
00: 09: 3806 სისხლის სისტემა. მაგალითად, ადამიანებში სისხლის მიმოქცევა.
00:09:4416 ვირუსებს მხოლოდ მაშინ ჰქონდათ აზრი, როდესაც მოლეკულური ბიოლოგია დაიბადა, როგორც მეცნიერება, რადგან ისინი
00: 09: 5007 იმდენად მცირე, რომ ერთადერთი მართლაც მნიშვნელოვანი რაც მათ აქვთ არის მათი გენეტიკური მითითებები,
00: 09: 5528 მათი დნმ ან მათი რნმ.
00: 09: 5822 ისინი ზოგადად იცავს მას ქურთუკში, მაგრამ ქურთუკი არის. უმეტესწილად ინერტულია, გარდა
00: 10: 0422 ეხმარება მათ მოხვდნენ შემდეგ ინფიცირებულ უჯრედში, ან მომდევნო უჯრედში, რომლითაც ისინი ინფიცირდებიან.
00:10:1317 ზოგიერთ მათგანს აქვს რამდენიმე სხვა ცილა, რომელიც ხელს უწყობს ინფექციის დაწყებას.
00:10:1903 და შემდეგ, ჩვენ ახლა ვსწავლობთ ვირუსების შესახებ, რომლებიც ძალიან დიდი და რთულია - გასაკვირი.
00:10:2526 ისინი რეალურად ბაქტერიების ზომის არიან.
00:10:2827 მაგრამ რაც მათ განასხვავებს არის ის, რომ ისინი უჯრედში უნდა იყვნენ გასამრავლებლად, ხოლო ბაქტერიები
00: 10: 3823 შეიძლება გამრავლდეს, როგორც თავისუფალი ცოცხალი ორგანიზმები.
00: 10: 4403 ვირუსების გამოვლენის გზა არის დაფის ტესტი.
00:10:4926 ჩვენ გვაქვს მგრძნობიარე უჯრედების გაზონი.
00:10:5321 ისინი შეიძლება იყოს ძუძუმწოვრების უჯრედები, ისინი შეიძლება იყოს ბაქტერიული უჯრედები.
00: 10: 5808 ჩვენ ვირუსის რამდენიმე ნაწილაკი ჩავაგდეთ.
00: 11: 0028 ეს ვირუსის ნაწილაკები ღეჭავს გაზონს ცენტრიდან, სადაც ისინი ჩნდებიან და წარმოიქმნება
00: 11: 0715 დაფა.
00: 11: 0915 და თუ დაითვლით დაფების რაოდენობას, თქვენ იცით რამდენი ვირუსი იყო იქ.
00: 11: 1426 და თუ გააკეთებ. თუ ორჯერ მეტ ვირუსს დაანგრევთ, მიიღებთ ორჯერ მეტ დაფას,
00:11:2028 ასე რომ, ეს არის უაღრესად რაოდენობრივი ტესტი და ბაქტერიული გენეტიკა გაკეთდა ამ ამოცანების გამოყენებით.
00: 11: 2917 ეს ტექნიკა.
00: 11: 3023 აქ, ჩვენ შეგვიძლია დავინახოთ პაწაწინა დაფები, რომლებიც დამზადებულია ერთგვარი ბაქტერიული ვირუსით, ან უზარმაზარი დაფები.
00:11:4100 პოლიოვირუსით, რომელიც მოოქროვილია ადამიანის უჯრედებზე.
00: 11: 4528 განსხვავება, რომელიც მე ვირუსებს შორის ძალიან მნიშვნელოვანია, არის განსხვავება
00: 11: 5301 წონასწორობის ვირუსები და არაბალანსირებული ვირუსები.
00: 11: 5816 წონასწორობის ვირუსებს აქვთ. არის ვირუსები, რომლებიც ძალიან დიდი ხნის განმავლობაში იყვნენ პარაზიტები
00:12:0617 კონკრეტული სახეობის.
00:12:0820 ასე რომ, ისინი ძალიან ადაპტირებულნი არიან ამ სახეობებთან, ამ სახეობის ცხოვრების წესთან, უჯრედებთან
00: 12: 1405 ამ სახეობის.
00:12:1623 და რაც ხდება არის ის, რომ ისინი ვითარდებიან რეალურად ნაკლებად ლეტალური, რადგან მათ არ სურთ
00: 12: 2209 კლავს მათ მასპინძლებს.
00:12:2313 მათ რომ მოეკლათ სახეობის ყველა წევრი, ეს ვირუსი იქნებოდა. თვითონ მოკვდებოდა.
00: 12: 2926 და, ამრიგად, ისინი იწვევენ საკმარის დაავადებებს, რათა ხელი შეუწყონ მათ გავრცელებას, მაგრამ არა.
00:12:3706 მოსწონს ცემინების ან ხველების გამოწვევა. მაგრამ ისინი არ კლავენ ადამიანების უმეტესობას.
00: 12: 4222 საერთო ცივი ვირუსი არის ძალიან კარგი მაგალითი ა. წონასწორობის ვირუსი ადამიანებში.
00:12:5007 შემდეგ, არის არაბალანსირებული ვირუსები.
00: 12: 5324 არაბალანსირებული ვირუსი არის ვირუსი, რომელიც გადახტა ერთი სახეობიდან მეორეზე.
00: 13: 0024 ისინი ჯერ არ არიან ადაპტირებული იმ ახალ მასპინძელთან.
00:13:0316 ისინი მხოლოდ იმ ახალ მასპინძელთან იყვნენ ცოტა ხნით, თუნდაც ათწლეულების განმავლობაში.
00: 13: 1021 და ისინი შეიძლება უკიდურესად მომაკვდინებელი იყოს, რადგან ეს არ არის მასპინძელი, რომელიც მათ აინტერესებთ.
00:13:1521 ასე რომ, ისინი არ განვითარებულან, რომ იყვნენ არალეტალური ამ მასპინძელში.
00:13:2203 ისინი შეიძლება ფაქტობრივად ცუდად გავრცელდნენ, ან შეიძლება ძალიან კარგად გავრცელდნენ.
00:13:2625 ისინი შეიძლება იყოს ძალიან ეფექტური, ძალიან არაეფექტური.
00:13:2919 არის უზარმაზარი ვარიაცია.
00: 13: 3218 მაგრამ ეს არის ვირუსები, რომლებიც ყველაზე დიდ პრობლემებს გვიქმნიან, რადგან ეს ვირუსები
00: 13: 3902 შეიძლება იყოს სასიკვდილო.
00: 13: 4002 ასე რომ, თუ ჩვენ ვსაუბრობთ წონასწორობის ვირუსებზე, ჩვენ ვსაუბრობთ პოლიოზე.
00:13:4503 პოლიომ თავის დროზე გამოიწვია. იყო. სასიკვდილო იყო ხალხის ძალიან მცირე ნაწილისთვის
00:13:5312 რომლებიც დაინფიცირდნენ ამით.
00:13:5509 ადამიანების უმეტესობამ არ იცოდა, რომ ინფიცირებული იყო -- 90%+.
00:13:5900 რამდენიმე ადამიანი რეალურად პარალიზებული იყო ამის გამო.
00: 14: 0226 და ფაქტობრივად რამდენიმე ადამიანი დაიღუპა.
00:14:0620 და ეს არის წონასწორული ვირუსის ბუნებაში, ძირითადად არალეტალური, თუმცა ზოგჯერ ლეტალური.
00: 14: 1422 სინამდვილეში ჩუტყვავილა იყო. არის არის ვირუსი, რომელიც სასიკვდილოა ადამიანების საკმაოდ დიდი რაოდენობისთვის,
00:14:2226 და თქვენ ნამდვილად გსურთ მიიღოთ ის, როდესაც ახალგაზრდა ხართ და გადალახოთ იგი.
00: 14: 2625 და ეს იყო ვაქცინაციის ხასიათი ადრეულ დღეებში.
00: 14: 3424 ჩვენ მიერ ნახსენები საერთო ცივი ვირუსი.
00: 14: 3822 წითელას ვირუსი, მეორე, რეალურად იწვევს საკმაოდ მძიმე ინფექციებს რამდენიმე ადამიანს.
00: 14: 4514 ადამიანების უმეტესობა მას გადალახავს რამდენიმე დღის განმავლობაში საწოლში ყოფნის შემდეგ.
00:14:5013 ჰერპესის ვირუსები ჩვენს გარშემოა და არის. keep infecting people, but are generally non-lethal.
00:15:0001 Now, non-equilibrium viruses.
00:15:0122 The most famous one of those is influenza virus.
00:15:0613 It's a natural virus of birds.
00:15:1006 In birds, it's generally not very lethal.
00:15:1328 It comes to humans and it's lethal to older people and very young people.
00:15:2114 And it's really a serious disease for adults to get.
00:15:2722 And that's why we try to vaccinate against it, although our vaccines are nowhere near
00:15:3219 as good as we'd like them to be.
00:15:3609 HIV is a virus that recently came to us from chimpanzees, but in fact it's not even
00:15:4403 a natural virus of chimpanzees.
00:15:4507 It seems to be a natural virus of monkeys.
00:15:5013 And they gave it to chimpanzees, which in turn gave it to us.
00:15:5527 SARS is a virus, probably, from bats.
00:16:0101 Ebola is a virus almost certainly from bats.
00:16:0422 Hantaan was from rodents.
00:16:0811 Those have been very lethal to humans, but generally in contained areas, because they.
00:16:1511 they haven't evolved to be able to spread very effectively.
00:16:1915 Now, let me turn to HIV, because it's a virus that we've heard so much about and that
00:16:2901 has been such a devastating virus to human beings.
00:16:3325 In. in the last few decades, the spread of the human immunodeficiency virus
00:16:4102 throughout the world has been a constant source of fear and news.
00:16:4909 It came into our midst, really, in the early 1980s.
00:16:5401 Before that, it was in human beings, but it was in very limited populations, mainly in Africa.
00:17:0213 Somewhere around the 1980s, it started spreading, coincident with travel.
00:17:0824 It was taken on airplanes in people from its. its source in Africa into Europe,
00:17:1609 into the United States.
00:17:2006 Making sense of. of HIV depended on having discovered the reverse transcriptase.
00:17:2715 So, our work in 1970 actually set the base for finding HIV, because HIV. it uses
00:17:3528 a reverse transcriptase, and it was that enzyme that revealed the nature of that virus.
00:17:4217 So, let me talk about the discovery of reverse transcription for a minute.
00:17:4917 In 1960, I began working on viruses.
00:17:5406 And I realized that in order to understand this lifecycle of viruses the thing to do
00:18:0117 was to examine the enzymes that made viral DNA or RNA.
00:18:0909 And so we actually discovered a number of polymerases in viruses all through the 1960s.
00:18:2104 And then in 1969, we found the polymerases that. that allow negative-strand viruses
00:18:3226 to be made.
00:18:3413 And they, as I mentioned earlier, are in the virus particle.
00:18:3717 And that suggested that if we were going to understand cancer inducing viruses,
00:18:4208 maybe we should look in the virus particle.
00:18:4600 Howard Temin, in the 1960s, had speculated that RNA. that the RNA tumor viruses --
00:18:5127 the viruses that have RNA as their genetic material but cause cancer -- might actually copy their
00:19:0124 RNA into DNA.
00:19:0318 But nobody could find clear evidence that that was true.
00:19:0800 And so in 1970, when we said, let's look in the virus particle, we found the enzyme
00:19:1520 that copies RNA into DNA.
00:19:1801 It was actually, for me, because I was a. had a background in that kind of experimentation,
00:19:2315 a very simple experiment.
00:19:2425 It took a matter of days to discover it.
00:19:2917 And in 1975, Howard Temin and I, along with Renato Dulbecco, who worked on DNA viruses,
00:19:3712 were honored with a Nobel Prize, because the work that the three of us had done
00:19:4309 really set the stage for understanding the genetic nature of cancer.
00:19:4713 And that was a big deal, scientifically, and actually has turned out to be a big deal in
00:19:5513 our treatment of cancer.
00:19:5822 It's nostalgic for me to remember back to the circumstances of doing those experiments
00:20:0607 because I was thinking about this diagram and realized that the.
00:20:1306 the tumor-inducing viruses didn't fit into it.
00:20:1613 And so got ahold of a stock of those viruses to test whether they might have a polymerase.
00:20:2506 And as I said, in a few days, found what we were looking for.
00:20:3200 The reverse transcriptase is an enzyme, now, that's understood in great detail.
00:20:3815 You can see how the DNA or RNA are threaded through the. the polymerase from its structure.
00:20:5122 So, let me say a few words about what the discovery of reverse transcription allowed.
00:21:0009 It allowed various kinds of understanding, and it allowed various kinds of technology.
00:21:0621 The understanding was the understanding that RNA tumor viruses are retroviruses, that they
00:21:1324 reverse transcribe their genome and integrate it into the host cell.
00:21:1911 And that really said that cancer was a consequence of genetic alteration of cells.
00:21:3026 And the other thing is that reverse transcription allowed biotechnologists to capture the
00:21:4104 genetic information from individual genes as messenger RNA that was reverse transcribed in the laboratory.
00:21:5103 And that became a central methodology of biotechnology.
00:21:5704 We also learned from work on the structure of the human genome that as much as 45% of
00:22:0621 the human genome arose by reverse transcription over historic time, mainly by the
00:22:1427 copying of mobile genetic elements, which are like viruses except they don't have an extracellular existence.
00:22:2301 They simply are part of cellular life.
00:22:2719 And finally, the discovery of reverse transcription set the base for, ten years later, the discovery
00:22:3503 of. რომ that the AIDS epidemic was being caused by the spread of a virus, HIV,
00:22:4520 and that that virus was a retrovirus, like the tumor viruses that up to then were
00:22:5217 the only ones known.
00:22:5506 So, it's been particularly gratifying to me that this discovery has reverberated down
00:23:0326 through time in so many different ways.
00:23:0626 And it really speaks to the importance of basic research.
00:23:1217 So, if we look at the life cycle of a retrovirus -- any retrovirus -- what it does is to
00:23:2028 make its way into a cell by fusing to the surface of the cell and popping the core of the virus
00:23:3009 into the cell itself.
00:23:3222 There, that core acts as an enzyme to make a DNA copy of the RNA in the virus.
00:23:4120 That in turn integrates itself, forming what's called the provirus.
00:23:4624 And the provirus then acts as a template to make proteins. to make RNA to make proteins.
00:23:5512 And those proteins come together to form new virus particles that bud out from the
00:24:0002 surface of the cell and become a free-living virus looking for a new potential host.
00:24:0705 It's a very interesting life cycle because the virus is actually finding its way
00:24:1324 into the chromosomes of the cell, turning itself from a free-living virus into genes of the cell.
00:24:2112 And that is a unique and remarkable way of the virus hiding out, allowing its transmission
00:24:3124 from one cell to the next cell to the next cell without the virus having to do anything,
00:24:3724 because every time the cell duplicates it duplicates the proviral DNA.
00:24:4426 Here it is budding off the surface of a cell.
00:24:4910 And so, let me just talk for a minute about how awful the AIDS epidemic has been,
00:24:5804 how powerful HIV has been.
00:25:0107 This. these are statistics from 2005.
00:25:0510 And I put them in here because that was sort of the peak of the epidemic.
00:25:1009 By that time, 65 million people had been infected all around the world, the bulk in Africa.
00:25:1701 There were 25 million who had been killed by the virus.
00:25:2222 40 million people were living with HIV, many in India, many in China, but the bulk in.
00:25:3005 in Africa.
00:25:3322 There were, at that time, 13,000 infections per day, 5 million people infected every year.
00:25:4427 It was a really devastating epidemic for the world.
00:25:5111 Now, if we look at it now, or at 2015, when the last statistics were available,
00:26:0108 what we see is an epidemic that is waning some but still really serious.
00:26:0801 So by now, 75 million people have been infected, 35 million have been killed, and there are
00:26:1528 still on the order of 40 million people living with AIDS.
00:26:2100 I've shown the 2005 numbers in parentheses.
00:26:2700 But there are now, as opposed to 2005, 18 million people on antiretrovirals,
00:26:3325 chemicals that prevent the growth of retroviral. of retroviruses.
00:26:4100 And those people are largely very healthy, and are also not transmitting virus,
00:26:4718 because the virus has been knocked down so effectively.
00:26:5207 And that's part of the reason why transmissions are down.
00:26:5524 So, the number of infections is now about 50% of what it was.
00:27:0210 The number dying is only 30% of what it was.
00:27:0819 And this. these retrovirals. antiretrovirals are making all the difference.
00:27:1414 But they're extremely expensive, even expensive in Africa, although much cheaper than here.
00:27:2406 And it's increasing the lifespan of people who are infected, it's lowering the infection rates,
00:27:2926 but it's not clear that it is the final answer.
00:27:3508 The final answer would be to make a vaccine that could prevent the transmission of HIV.
00:27:4306 And we. many, many other people in the scientific community are working on finding a way
00:27:5013 to vaccinate people.
00:27:5113 But this virus, as opposed to any other virus, has been a recalcitrant to our attempts to
00:27:5809 make a vaccine.
00:28:0126 So, HIV is the classic non-equilibrium virus.
00:28:0610 It's, as I say, endemic in African monkeys.
00:28:1015 It got a foothold in the human populations maybe 90 years ago.
00:28:1612 For a long time, it was found only in villages in Africa.
00:28:2107 Then, as. as transportation became more and more commonly used to take people
00:28:3006 from one continent to another, it seeded other continents and became a worldwide epidemic.
00:28:3800 It grows in one of the key cell types of our immune system, and so it actually knocks out
00:28:4419 our immune systems.
00:28:4609 And that's what. why it's a lethal virus.
00:28:4910 We die of some infection, not of HIV infection.
00:28:5807 And with that, I've finished with this discussion of viruses and of HIV.

  • Part 1: Introduction to Viruses